El grupo de investigación PARK de la Universidad de Extremadura, en colaboración con los ingenieros en Informática por la UEx Antonio Gragera y Alejandro Cristo, ha desarrollado una solución software para automatizar el análisis de imágenes provenientes de ensayos de microscopia de fluorescencia.
El
Coordinador del grupo, José Manuel Fuentes, profesor del Departamento de
Bioquímica y Biología Molecular y Genética de la Facultad de Enfermería de la
UEx, ha explicado que esta aplicación permite la cuantificación de imágenes sin
la necesidad de que el investigador esté presente.
Según
Fuentes, la principal ventaja que presenta este software sobre otros ya
existentes es la posibilidad de procesar las imágenes de forma secuencial y
automática, a la vez que se generan los resultados y estadísticas de manera
directa.
Esto
supone el ahorro de gran cantidad de tiempo a los investigadores, ya que son
convencionalmente éstos quienes han de realizar los cálculos de manera manual
sobre cada una de las imágenes, implicando la posibilidad de dedicarse a otras
labores de investigación en lugar de a tediosas tareas rutinarias de
cuantificación.
La
aplicación, bautizada como IfDotMeter, surgió en un primer momento para
facilitar el estudio de las alteraciones de procesos bioquímicos y celulares vinculadas
con la investigación que realiza el Grupo PARK en relación con la etiología de
la enfermedad de Parkinson, aunque es extensible al análisis cuantitativo de
imágenes de fluorescencia en cualquier contexto.
SENCILLEZ DE MANEJO
Aparte
de presentar una interfaz gráfica muy intuitiva que asegura la comodidad y
sencillez de manejo por parte del analista, la aplicación IfDotMeter
proporciona multitud de funcionalidades, entre las que se encuentran la
automatización del cálculo del área celular, la detección de proteínas en el
interior de la propia célula (proporcionando el área total de grupos,
localización, color y tamaño), el volcado de los resultados generados a una
hoja de cálculo para verificaciones y estudios posteriores, y la posibilidad de
generar datos denominados merge, composición de imágenes a falso color muy
útiles para análisis más avanzados
Por
otra parte, José Manuel Fuentes destaca la transversalidad de esta actividad en
la que han participado investigadores de áreas de trabajo tan diferentes como
las Ciencias de la Vida o la Ingeniería Informática, constituyendo un equipo
multidisciplinar para la realización de actividades de I+D+i con orientación,
no sólo al desarrollo científico, sino también al sector productivo.
La
aplicación ha sido ya registrada y está pendiente de publicación en diversas
revistas de las áreas implicadas. En la actualidad, ya se está trabajando en
otros desarrollos de interés científico, y no se descarta la creación de una
spin-off en un futuro.
El
grupo PARK es el único de la región integrado en el Centro de Investigación
Biomédica sobre Enfermedades Neurodegenerativas (CIBERNED), perteneciente al
Instituto de Salud Carlos III, el cual lidera a nivel nacional el estudio de
este tipo de patologías y está integrada en la Red Internacional de Centros de
Excelencia en Investigación sobre Neurodegeneración (CoEN).
